Dans le premier cas, celà s'appliquera à vim en toutes circonstances. Dans le 2eme, à vim uniquement lorsqu'il est appelé dans mutt (en général préférable).

Note pour les débutants : celà suppose biensûr que vim, version améliorée de vi soit installé. Je vous le conseille fortement pour ses nombreuses fonctionnalités et sa coloration syntaxique. une fois installé, pour le configurer c'est très simple : un sample vimrc est fourni dans le répertoire doc par défaut de votre distrib (/usr/doc/vim en général). Copiez le dans votre home directory et renommez le en .vimrc.
Pour profiter de la coloration syntaxique, les debianiste devront installer vim-rt en sus (pour les redhat-based je crois que c'est vim-X11 mais je suis plus très sûre). Dans tous les cas, décommenter les lignes suivantes dans ~/.vimrc:

if &t_Co > 2 || has("gui_running")
syntax on
set hlsearch
endif